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五年任务期满，企业号需要回到地球维护一年，舰船人员们也都回地面休整。Spock选择去新瓦肯工作，直到Jim再次担任舰长之职，带领他们执行新的任务（Spock百分百确定星联会再次让Jim作为舰长执行任务，而Jim，用人类的话说“嘿，我们是全宇宙最好的搭档！”所以，他回到舰长身边担任大副一职将是符合逻辑而且毫无疑问的。）
临行前Spock特意与舰长会面作为告别，知道他要去新瓦肯工作的决定，他的舰长并没有多说什么，蕴着水光的蓝眼睛望着他，勾起嘴角笑了笑：“我会想你的。”这让Spock想起几年前的那一幕，于是他思考了一秒钟，开口说了“me too.” 他的舰长惊讶地瞪大了蓝眼睛，随即又笑眯了眼：“噢~Spock，你终于不那么混蛋了！”
Spock回到了新瓦肯……不，这其实是他第一次踏上这片土地，作为瓦肯人的新家园，它有着与瓦肯星非常相似的自然环境和地理风貌气候特征。Spock是非常习惯这样的炎热干燥的，但随他一起来的Nyota很明显被热得不轻，但她并没有抱怨什么，就像他的母亲，这让他非常钦佩。
Spock和Nyota即将进行正式链接完成瓦肯结婚仪式。他们并不是T'hy'la，当然，T'hy'la如今是非常稀有的，而作为半瓦肯Spock更不会奢望拥有。
瓦肯婚礼并无邀请许多亲朋好友欢聚一堂的习俗，Nyota尊重这个习俗，但Spock人类的那一半还是决定邀请舰长与医生前来观礼。当他把这一消息通过PADD即时通讯告诉他的舰长时，屏幕里的Jim一动不动将近一分钟，这让他怀疑是否是网络故障，而舰长终于动了，眨了眨眼睛，露出非常遗憾的神情道：“噢~Spock，恭喜你，和Uhura，但你知道，我现在在地面工作非常忙，时间都排满了，就……去不了了……但我会寄礼物过去的！再次的，祝贺你们。”舰长的眼睛和声音都湿漉漉的，Spock疑惑地想着冲进脑海的这个形容词，不合逻辑，但很合适。而后他反应过来，Jim不会来观礼了。
医生同样也没有来。听到他结婚的消息，医生挑起眉毛暴躁地咕哝了一句什么，然后拿起手边的酒杯喝了一大口，像是压下了所有的暴躁，对Spock说：“不管怎么样，你要结婚了，恭喜你们！”
Spock与Nyota完成了链接，它稳定，兼容度也相对来说还算高，这是非常好的结果。而他们的婚后生活也很和睦，瓦肯人不会轻易与人起争执，Uhura也非常了解瓦肯文化，了解瓦肯人，不会抱怨不浪漫，就算偶尔闹了点小脾气，Spock也总会谦让她。
而且他们俩都非常忙，毕竟他们不是来旅游度蜜月的，Spock在瓦肯科学院工作，而嫁到瓦肯的Uhura也迅速找了份工作。
忙碌的工作使他们无暇顾及其他……忙碌到Spock在一个偶然的闲暇里才忽然想起自己在瓦肯已经7个月零8天了，但他没有收到舰长的任何讯息，除了6个月前的那份结婚贺礼。
这并不符合Jim的性格——Spock挑着眉想。他是否出了什么事？他的舰长总是麻烦事缠身，也许该联络一下Jim？关心舰长是大副的职责……而且Jim是他的朋友。Spock在心里想着又默默加了一句。
而没等到Spock联系Jim，他的舰长就先联系他了。通讯视频里的Jim看上去瘦了许多，但精神总算还好，笑着和他打招呼，说好久不见，说最近工作超级多，忙到没时间喝酒泡妞，说企业号的维护比预期慢了，但参与维护的Scott透露说他们给银女士做了各种升级，她将会更棒！说这些的时候，Jim的蓝眼睛闪着星光。最后，Jim看着Spock说：“抱歉，我一会儿还有工作，今天先聊到这里吧，替我向Uhura问好。”
此后每过一两个月Jim总会与Spock视频通讯一回，每次总是Jim说这说那，Spock静静听着，就像他们在企业号上一样。只是他们好久没下棋了，Spock略有遗憾的想，Jim是个可敬的对手，他总是能出其不意的下出一步高棋，这对他的逻辑无疑是个挑战，而他们的象棋之夜也都是非常愉快的。
不过这并不是永久的遗憾，再过三个月，企业号就能够维护完毕重新起航，届时他便又能与Jim下棋了。Spock想。
但Nyota怀孕了。
在下一个与舰长通讯的时候，Spock告诉Jim，因为Nyota怀了孩子，他们俩都需要守护孩子直到出生，因为瓦肯宝宝从胎儿期就需要稳定的链接，Nyota没有瓦肯精神力，Spock便更需要时刻待在胎儿身边，企业号也无疑不是个养胎的好地方。
他的舰长出乎意料的并没有非常惊讶，只是点点头，笑着说：“恭喜你啦Spock，当爸爸了！你安心‘养胎’吧，如果到时候星联让我继续执掌企业号，我会为你留着大副位置的！”
企业号重新起航了，Jim是舰长，星联也给了Jim特权，那一批老船员都回了企业号，除了Spock与Uhura。但谁都知道，他俩会回来的。
企业号起航那天，Spock与Uhura原本想去送行，却因为胎动异常而没有成行。很可惜，Uhura说，已经一年多没有见到大家了……是一年3个月零9天，Spock默默想。
星联定下了第二个五年计划，于是企业号再次去了深空，未知的宇宙充满未知的危险，而Jim的麻烦体质更是雪上加霜。Spock望着无垠的夜空忧虑地想起Jim在三年前死里逃生那次对他说“没有你我可怎么办”……保护舰长是大副义不容辞的职责，如今企业号上的科学官是Carol，同时兼任代理大副，不得不承认她是个优秀的女性，拥有足够智慧的头脑，却终究不够力量去保护舰长的人身安全。
再等一年，我就可以回企业号了，Jim，我的舰长，请你保重。
一年以后，在Spock准备登上飞船前往企业号时，却收到企业号舰长James T Kirk再次拯救了所有人，自己却英勇牺牲的消息。
“舰长无法逃脱一死”。一语成谶。
逻辑告诉Spock不必登上去企业号的飞船了，因为就算他到了那儿，也见不到舰长最后一面了。而他人类那一半的情感呐喊着必须去，Jim被葬在那一片宇宙，他一个人，多么孤独呢，他要去找到他……他要带他回来！
Spock终究是去了那里。
尽管很不舍，企业号的船员们还是遵照传统将他们的舰长放进太空舱葬在了宇宙。
医生告诉了Spock安葬的区域，但那么小的一个盒子，在这个浩瀚无垠的宇宙空间里，依然小得如尘埃。
Spock找不到他的舰长。
Spock回来了。他终其一生也不会知道他真正错过的是什么，但他知道他的一部分灵魂随他的舰长一起葬在了那片茫茫无际的宇宙空间。